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PCR實驗室設(shè)計之分區(qū)及其配置

更新時間:2022-11-15

  PCR實驗室在臨床上又稱基因擴增實驗室。理想的的標(biāo)準(zhǔn)PCR設(shè)計組合式實驗室包括4個分區(qū),分別是:試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴增反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū),分區(qū)及其儀器設(shè)備配置參見下圖。

  普通的 PCR 儀對標(biāo)本擴增后,需再經(jīng)電泳或雜交實驗分析,才能判斷標(biāo)本含有哪種細(xì)菌、病毒。

  如果使用全自動分析儀如實時熒光定量PCR儀,由于擴增與分析集成在一臺儀器內(nèi)進(jìn)行,故擴增區(qū)與分析區(qū)合并為一, PCR 實驗室只需設(shè)置3個房間。PCR 兩種分區(qū)及其配置置參見下圖 。

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  PCR實驗室各區(qū)主要功能及相關(guān)要求描述:

  試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)(I區(qū));儲存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備,可配置電泳溶液。試劑配置在潔凈臺內(nèi)操作,一般采用 900mm 的垂直單向流潔凈臺。冰箱一般為4℃冷藏柜。

  標(biāo)本制備區(qū)(Ⅱ區(qū)):主要是核酸(RNA、DNA)的提取和純化,包括臨床標(biāo)本的保存、核酸儲存、核酸加人到擴增反應(yīng)管、cDNA的合成。核酸提取時需使用苯酚、氯仿等有毒致癌物,高速離心后得到沉淀的 DNA。PCR反應(yīng)的*大特點是具有較大的擴增能力與極高的靈敏性,但也正是這種特點,使得極其微量的污染即可造成假陽性的檢測結(jié)果,因此核酸的純化操作應(yīng)生物安全柜內(nèi)進(jìn)行,為避免提取核酸氣溶膠在柜內(nèi)反復(fù)循環(huán),造成標(biāo)本間交叉污染,出現(xiàn)假陽性結(jié)果,*好采用全外排的ⅡB2生物安全柜。標(biāo)本及 DNA需在一20℃或-80℃的低溫冰箱中保存。處理大分子 DNA時使用超聲波水浴儀(水浴鍋)。房間相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進(jìn)入的氣溶膠污染。

  擴增反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū)(Ⅲ區(qū)):主要進(jìn)行的操作為 DNA 或 cDNA 擴增。巢式PCR 測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應(yīng)管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)潔凈臺內(nèi)進(jìn)行。房間相對于產(chǎn)物分析區(qū)應(yīng)為正壓,相對于標(biāo)本制備區(qū)為負(fù)壓。

  擴增產(chǎn)物分析區(qū)(Ⅳ區(qū)):對擴增后的產(chǎn)物種類進(jìn)行分析,判斷是哪種細(xì)菌、病毒。對于普通的PCR 儀,目前*常用的方法是電泳分析。為防止分析產(chǎn)物污染其他區(qū)域,房間應(yīng)為負(fù)壓。設(shè)備中電熱板額定功率1~4kw,發(fā)熱量較大。



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